نوع المقالة : بحث
الملخص
تُعد بكتيريا الراكدة البومانية Acinetobacter baumannii المقاومة للعديد من المضادات الحيوية واحدة من البكتيريا الصاعدة كتهديد للصحة على مستوى العالم. وقد أظهر التباين الطوري (phase variation) في هذه البكتيريا أنه يلعب دورًا في التبديل بين الانماط الظاهرية المختلفة والتي أظهرت قدرات مختلفة على مقاومة البكتريا للظروف المعاكسة. في هذه الدراسة، تم تطبيق التحليل القائم على الكمبيوتر لتوصيف التكرارات التسلسلية البسيطة (SSRs) في الحمض النووي لـ 32 جينومًا من بكتريا الراكدة البومانية، وتم تقييم قدرتها على التوسط في الاختلاف الطوري لبعض الجينات. تم فحص SSRs من حيث أنواعها واطوالها الدورية وأنماطها وموقعها داخل المناطق المشفرة أو المناطق بين الجينات. تم الكشف عن إجمالي 2277 موضعًا لـ SSR في إجمالي الجينومات التي تم تحليلها، والتي تهيمن عليها تتابعات الادنين/ الثايمين (A/T) المتعددة والتي تمثل 57.1٪ من إجمالي SSRs المكتشفة. باستثناء المناطق التي لا تؤثر على التعبير الجيني، بلغ العدد الإجمالي للجينات المرشحة لحدوث التباين الطوري فيها 1860 جينًا، وبمعدل من 49 إلى 79 جينًا لكل جينوم. تحتوي غالبية هذه الجينات على SSRs ضمن التسلسلات التي تشفر للبروتين. صنفت هذه الجينات الى 402 مجموعة اعتمادا على تماثلها، وكان 42 منها في موجودا في أكثر من 50% من إجمالي العزلات التي تم تحليلها. أظهر 27 جينًا فقط تباينًا في اطوال SSR الخاصة بها بين الجينومات المختلفة، وخمسة منها فقط تغايرت بين حالات تعبير جيني مختلفة (تشغيل/إيقاف) في الجينومات المختلفة. بشكل عام، كانت (SSRs) المشخصة قصيرة في الغالب، ولها دور محدود في تباين الطور في المستضدات السطحية، ولكنها قد تتوسط تباين الطور في الجينات التي من المفترض أن تشارك في مقاومة الأدوية، مما يعكس أهمية محتملة لها في تنظيم قدرة هذه البكتريا على مقاومة المضادات الحيوية.